В кассе есть несколько счётчиков сумм. Их можно корректировать только на увеличение. Поэтому если у вас выявлено заниженная сумма прихода, то вам нужно сделать корректировку прихода. То есть увеличить счётчик суммы прихода до нужного значения.

При нажатии кнопки оплата будет показана другая форма параметров, 

где нужно выбрать тип коррекции, самостоятельно выявленная ошибка, или требование, направленное из налоговой. 

И реквизиты документа.